Chaque jeu de la série des Borderlands propose plusieurs missions. La mission principale, généralement composée d'une série de missions, permet de suivre l'histoire proprement dite. Les missions secondaires permettent d'étendre la durée de vie du jeu et de gagner davantage d'expérience et de butin.
Les liens suivants mènent vers la liste des missions principales et secondaires de chaque jeu :